MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spiroplasma taiwanense CT-1 plasmid

Total Repeats: 279

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021832	GAT	2	6	209	214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
2	NC_021832	AT	3	6	257	262	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
3	NC_021832	T	6	6	271	276	0 %	100 %	0 %	0 %	525905725
4	NC_021832	CTA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905725
5	NC_021832	AGAA	2	8	288	295	75 %	0 %	25 %	0 %	525905725
6	NC_021832	A	7	7	339	345	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
7	NC_021832	GAGTTA	2	12	378	389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
8	NC_021832	AT	3	6	415	420	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
9	NC_021832	A	6	6	434	439	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
10	NC_021832	TTA	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
11	NC_021832	A	6	6	489	494	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
12	NC_021832	ATT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
13	NC_021832	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
14	NC_021832	ATA	2	6	556	561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
15	NC_021832	A	6	6	636	641	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
16	NC_021832	TAT	2	6	642	647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
17	NC_021832	TTTG	2	8	654	661	0 %	75 %	25 %	0 %	525905725
18	NC_021832	ATA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
19	NC_021832	ATA	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
20	NC_021832	TTA	2	6	787	792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
21	NC_021832	TTTAAA	2	12	797	808	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
22	NC_021832	ACAA	2	8	811	818	75 %	0 %	0 %	25 %	525905725
23	NC_021832	T	6	6	888	893	0 %	100 %	0 %	0 %	525905725
24	NC_021832	TGT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905725
25	NC_021832	GAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905725
26	NC_021832	TAT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
27	NC_021832	TAAA	2	8	967	974	75 %	25 %	0 %	0 %	525905725
28	NC_021832	TAAAT	2	10	983	992	60 %	40 %	0 %	0 %	525905725
29	NC_021832	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905725
30	NC_021832	TA	3	6	1015	1020	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
31	NC_021832	A	6	6	1063	1068	100 %	0 %	0 %	0 %	525905725
32	NC_021832	GAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
33	NC_021832	AAC	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905725
34	NC_021832	AT	3	6	1096	1101	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
35	NC_021832	C	7	7	1108	1114	0 %	0 %	0 %	100 %	525905725
36	NC_021832	AT	3	6	1124	1129	50 %	50 %	0 %	0 %	525905725
37	NC_021832	ATT	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905726
38	NC_021832	A	7	7	1493	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	525905726
39	NC_021832	TAC	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905726
40	NC_021832	AAT	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905726
41	NC_021832	ATA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905726
42	NC_021832	TTA	3	9	2114	2122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
43	NC_021832	TTA	2	6	2159	2164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
44	NC_021832	T	7	7	2209	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	525905727
45	NC_021832	TTTCA	2	10	2223	2232	20 %	60 %	0 %	20 %	525905727
46	NC_021832	CCA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525905727
47	NC_021832	TAT	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
48	NC_021832	ATTTG	2	10	2303	2312	20 %	60 %	20 %	0 %	525905727
49	NC_021832	ATT	2	6	2314	2319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
50	NC_021832	TTAT	2	8	2339	2346	25 %	75 %	0 %	0 %	525905727
51	NC_021832	TAA	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905727
52	NC_021832	ATAA	2	8	2361	2368	75 %	25 %	0 %	0 %	525905727
53	NC_021832	T	6	6	2374	2379	0 %	100 %	0 %	0 %	525905727
54	NC_021832	ATT	3	9	2389	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
55	NC_021832	AT	3	6	2435	2440	50 %	50 %	0 %	0 %	525905727
56	NC_021832	T	6	6	2440	2445	0 %	100 %	0 %	0 %	525905727
57	NC_021832	TAT	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
58	NC_021832	ATT	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
59	NC_021832	TCA	2	6	2507	2512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
60	NC_021832	TAT	2	6	2518	2523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
61	NC_021832	AATTTT	2	12	2563	2574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
62	NC_021832	TAAA	2	8	2592	2599	75 %	25 %	0 %	0 %	525905727
63	NC_021832	TGG	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525905727
64	NC_021832	CTA	2	6	2658	2663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
65	NC_021832	TCA	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
66	NC_021832	TTTAA	2	10	2708	2717	40 %	60 %	0 %	0 %	525905727
67	NC_021832	ATT	2	6	2731	2736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
68	NC_021832	ATT	2	6	2755	2760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
69	NC_021832	AT	3	6	2813	2818	50 %	50 %	0 %	0 %	525905727
70	NC_021832	A	7	7	3033	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	525905728
71	NC_021832	TTA	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905728
72	NC_021832	ACA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905728
73	NC_021832	AGT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905728
74	NC_021832	AGA	2	6	3134	3139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
75	NC_021832	AGC	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905728
76	NC_021832	A	6	6	3156	3161	100 %	0 %	0 %	0 %	525905728
77	NC_021832	GAA	2	6	3168	3173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
78	NC_021832	TAA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905728
79	NC_021832	A	6	6	3271	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	525905728
80	NC_021832	TA	3	6	3277	3282	50 %	50 %	0 %	0 %	525905728
81	NC_021832	TAG	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905728
82	NC_021832	GAA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
83	NC_021832	AAG	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
84	NC_021832	A	6	6	3438	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	525905728
85	NC_021832	A	6	6	3535	3540	100 %	0 %	0 %	0 %	525905729
86	NC_021832	TTA	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
87	NC_021832	TTA	2	6	3550	3555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
88	NC_021832	GTA	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
89	NC_021832	TA	3	6	3635	3640	50 %	50 %	0 %	0 %	525905729
90	NC_021832	ATA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
91	NC_021832	AAG	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905729
92	NC_021832	ATA	2	6	3698	3703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
93	NC_021832	TAAT	2	8	3716	3723	50 %	50 %	0 %	0 %	525905729
94	NC_021832	AAT	3	9	3721	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
95	NC_021832	TTA	2	6	3730	3735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
96	NC_021832	ATA	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
97	NC_021832	AT	3	6	3774	3779	50 %	50 %	0 %	0 %	525905729
98	NC_021832	A	6	6	3789	3794	100 %	0 %	0 %	0 %	525905729
99	NC_021832	GAT	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
100	NC_021832	TAA	2	6	3897	3902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
101	NC_021832	A	7	7	3934	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	525905729
102	NC_021832	CAA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905729
103	NC_021832	TAATTT	2	12	3975	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
104	NC_021832	T	6	6	3984	3989	0 %	100 %	0 %	0 %	525905729
105	NC_021832	T	6	6	4005	4010	0 %	100 %	0 %	0 %	525905729
106	NC_021832	AACT	2	8	4016	4023	50 %	25 %	0 %	25 %	525905729
107	NC_021832	AATT	2	8	4043	4050	50 %	50 %	0 %	0 %	525905729
108	NC_021832	AGT	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
109	NC_021832	GCT	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525905729
110	NC_021832	GCA	3	9	4108	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905729
111	NC_021832	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	525905729
112	NC_021832	GCA	3	9	4201	4209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905729
113	NC_021832	GAGT	2	8	4214	4221	25 %	25 %	50 %	0 %	525905729
114	NC_021832	A	7	7	4230	4236	100 %	0 %	0 %	0 %	525905729
115	NC_021832	CAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905729
116	NC_021832	TAA	2	6	4334	4339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
117	NC_021832	CAG	2	6	4346	4351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905729
118	NC_021832	TTG	2	6	4365	4370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905729
119	NC_021832	CAA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905729
120	NC_021832	AAT	2	6	4413	4418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
121	NC_021832	T	7	7	4495	4501	0 %	100 %	0 %	0 %	525905730
122	NC_021832	AT	3	6	4519	4524	50 %	50 %	0 %	0 %	525905730
123	NC_021832	AT	3	6	4554	4559	50 %	50 %	0 %	0 %	525905730
124	NC_021832	T	6	6	4574	4579	0 %	100 %	0 %	0 %	525905730
125	NC_021832	TAT	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
126	NC_021832	TAT	2	6	4663	4668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
127	NC_021832	T	6	6	4668	4673	0 %	100 %	0 %	0 %	525905730
128	NC_021832	TGA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905730
129	NC_021832	AT	3	6	4711	4716	50 %	50 %	0 %	0 %	525905730
130	NC_021832	TTA	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
131	NC_021832	TA	5	10	4732	4741	50 %	50 %	0 %	0 %	525905730
132	NC_021832	A	8	8	4784	4791	100 %	0 %	0 %	0 %	525905730
133	NC_021832	AGA	3	9	4816	4824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905730
134	NC_021832	AATT	2	8	4885	4892	50 %	50 %	0 %	0 %	525905730
135	NC_021832	A	6	6	4938	4943	100 %	0 %	0 %	0 %	525905730
136	NC_021832	AT	3	6	4945	4950	50 %	50 %	0 %	0 %	525905730
137	NC_021832	A	6	6	4980	4985	100 %	0 %	0 %	0 %	525905730
138	NC_021832	ATT	2	6	4993	4998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
139	NC_021832	TTG	2	6	5020	5025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905730
140	NC_021832	TAA	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905730
141	NC_021832	A	6	6	5081	5086	100 %	0 %	0 %	0 %	525905730
142	NC_021832	ATT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
143	NC_021832	AT	3	6	5375	5380	50 %	50 %	0 %	0 %	525905731
144	NC_021832	A	6	6	5382	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	525905731
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151	NC_021832	TTAA	2	8	5596	5603	50 %	50 %	0 %	0 %	525905731
152	NC_021832	TTATAT	2	12	5657	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905732
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155	NC_021832	A	8	8	5776	5783	100 %	0 %	0 %	0 %	525905732
156	NC_021832	TTA	2	6	5803	5808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905732
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265	NC_021832	A	7	7	10362	10368	100 %	0 %	0 %	0 %	525905739
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269	NC_021832	A	7	7	10482	10488	100 %	0 %	0 %	0 %	525905740
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271	NC_021832	TTA	2	6	10513	10518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905740
272	NC_021832	AAT	2	6	10560	10565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905740
273	NC_021832	AT	3	6	10617	10622	50 %	50 %	0 %	0 %	525905740
274	NC_021832	ATTT	2	8	10644	10651	25 %	75 %	0 %	0 %	525905740
275	NC_021832	TAAAT	2	10	10701	10710	60 %	40 %	0 %	0 %	525905740
276	NC_021832	T	7	7	10743	10749	0 %	100 %	0 %	0 %	525905740
277	NC_021832	GAT	2	6	10750	10755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905740
278	NC_021832	TAA	2	6	10812	10817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905740
279	NC_021832	AGA	2	6	10823	10828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905740

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.